《表觀遺傳學(xué)前沿》共分11章,包括染色質(zhì)結(jié)構(gòu)與功能、核小體定位、染色質(zhì)重塑、組蛋白修飾、DNA甲基化、RNA可變剪接的表觀遺傳學(xué)機(jī)制、非編碼RNA研究進(jìn)展、假基因研究進(jìn)展、表觀遺傳學(xué)研究實(shí)驗(yàn)技術(shù)簡介、表觀遺傳學(xué)相關(guān)數(shù)據(jù)庫簡介及表觀遺傳學(xué)的功能。
在主要闡述了表觀遺傳學(xué)的基本知識的基礎(chǔ)上,結(jié)合本領(lǐng)域國內(nèi)外最新科研成果,《表觀遺傳學(xué)前沿》系統(tǒng)總結(jié)介紹了當(dāng)前表觀遺傳學(xué)領(lǐng)域的前沿進(jìn)展。
《表觀遺傳學(xué)前沿》可供從事生命科學(xué)研究的人員參考,也可作為高等院校遺傳學(xué)等相關(guān)專業(yè)研究生的教材。
我們熱切希望這本書能為本領(lǐng)域研究人員、教師和學(xué)生提供有價值的新知識,但由于這一領(lǐng)域的快速發(fā)展,加之尚有許多問題學(xué)術(shù)界仍在探討未有定論,特別是編者學(xué)術(shù)水平有限,書中肯定有諸多不足和錯誤之處,敬請讀者批評指正。
蔡祿
2012年10月
第1章 染色質(zhì)的結(jié)構(gòu)與功能
1.1 細(xì)胞核的結(jié)構(gòu)與功能
1.1.1 細(xì)胞核的結(jié)構(gòu)
1.1.2 細(xì)胞核的功能
1.2 染色質(zhì)結(jié)構(gòu)
1.2.1 染色質(zhì)纖維
1.2.2 染色質(zhì)分為常染色質(zhì)和異染色質(zhì)
1.3 核小體
1.3.1 發(fā)現(xiàn)歷史
1.3.2 核小體的結(jié)構(gòu)
1.3.3 相位
1.4 染色體
1.4.1 染色體的化學(xué)組成
1.4.2 染色體的DNA
1.4.3 染色體的特征性結(jié)構(gòu)
1.5 核仁結(jié)構(gòu)與功能
1.5.1 核仁的化學(xué)組成
1.5.2 核仁的結(jié)構(gòu)
1.5.3 核仁的形成
1.5.4 核仁的功能
參考文獻(xiàn)
第2章 核小體定位
2.1 基因組上核小體定位的實(shí)驗(yàn)圖譜
2.1.1 基因組尺度核小體定位作圖的基本策略
2.1.2 基因組尺度核小體定位圖譜
2.2 基因組上核小體分布的一般模式
2.2.1 DNA轉(zhuǎn)錄相關(guān)位點(diǎn)鄰近核小體分布
2.2.2 DNA復(fù)制起始位點(diǎn)鄰近區(qū)核小體分布
2.2.3 核小體定位的“統(tǒng)計(jì)定位”模型
2.3 核小體定位的理論研究
2.3.1 從DNA序列到核小體定位
2.3.2 基于DNA結(jié)構(gòu)的物理性質(zhì)預(yù)測核小體定位
2.3.3 核小體定位的反式因子
2.4 鄰近核小體和染色質(zhì)高級結(jié)構(gòu)影響核小體定位
2.4.1 核小體串珠
2.4.2 高級染色質(zhì)結(jié)構(gòu)的影響
2.5 核小體定位與基因表達(dá)調(diào)控
2.6 總結(jié)與展望
參考文獻(xiàn)
第3章 染色質(zhì)重塑
3.1 染色質(zhì)重塑概述
3.2 SWI/SNF復(fù)合物
3.2.1 SWI/SNF復(fù)合物的組成
3.2.2 SWI/SNF復(fù)合物的結(jié)構(gòu)域和功能
3.2.3 SWI/SNF復(fù)合物與癌癥
3.3 ISWI復(fù)合物
3.3.1 ISWI復(fù)合物的組成
3.3.2 ISWI復(fù)合物的功能
3.4 CHD復(fù)合物
3.4.1 CHD復(fù)合物的組成
3.4.2 Chd蛋白的位置和組織表達(dá)模式
3.4.3 Chd蛋白在染色質(zhì)組裝和重塑過程的作用
3.4.4 CHD家族成員的多亞基復(fù)合物
3.4.5 Chd蛋白和轉(zhuǎn)錄延伸
3.4.6 發(fā)育和分化階段的Chd蛋白
3.4.7 Chd蛋白與人類疾病
3.4.8 總結(jié)與展望
3.5 IN080復(fù)合物
3.5.1 IN080復(fù)合物的組成
3.5.2 IN080復(fù)合物的功能
3.5.3 SWR1復(fù)合物的組成
3.5.4 SWR1復(fù)合物的功能
3.5.5 總結(jié)與展望
3.6 染色質(zhì)重塑模式和機(jī)制
3.6.1 染色質(zhì)重塑模式
3.6.2 染色質(zhì)重塑機(jī)制
3.7 總結(jié)與展望
參考文獻(xiàn)
第4章 組蛋白修飾
4.1 組蛋白修飾概述
4.1.1 組蛋白的分類和性質(zhì)
4.1.2 組蛋白修飾的種類
4.2 組蛋白修飾酶及其相關(guān)復(fù)合物
4.2.1 乙;讣捌鋸(fù)合物
4.2.2 組蛋白甲基化酶
4.3 組蛋白變體及其修飾
4.3.1 組蛋白變體概述
4.3.2 組蛋白變體修飾
4.4 組蛋白密碼
參考文獻(xiàn)
第5章 DNA甲基化
5.1 DNA甲基化概況
5.2 真核生物DNA甲基化分布模式
5.3 真核生物DNA甲基化修飾系統(tǒng)
5.3.1 DNA甲基轉(zhuǎn)移酶
5.3.2 甲基化結(jié)合蛋白
5.4 DNA甲基化與遺傳物質(zhì)的穩(wěn)定性
5.4.1 DNA甲基化與DNA復(fù)制起始
5.4.2 DNA甲基化與錯配修復(fù)
5.4.3 DNA甲基化與轉(zhuǎn)座子失活
5.5 DNA甲基化與基因表達(dá)調(diào)控
5.5.1 DNA甲基化直接影響一些轉(zhuǎn)錄因子的結(jié)合活性
5.5.2 DNA甲基化結(jié)合蛋白與轉(zhuǎn)錄抑制
5.6 DNA甲基化與其他表觀遺傳修飾的關(guān)系
5.6.1 DNA甲基化與核小體定位
5.6.2 DNA甲基化與組蛋白修飾
5.6.3 DNA甲基化與非編碼
RNA
參考文獻(xiàn)
第6章 RNA可變剪接的表觀遺傳學(xué)機(jī)制
6.1 引言
6.2 可變剪接的基本機(jī)制
6.2.1 可變剪接的基本概念
6.2.2 可變剪接的基本類型
6.2.3 可變剪接的基本機(jī)制
6.3 轉(zhuǎn)錄與剪接同時進(jìn)行的機(jī)制
6.4 可變剪接受RNA聚合酶Ⅱ延伸速率的控制
6.5 可變剪接的表觀遺傳學(xué)機(jī)制
6.5.1 可變剪接與核小體定位
6.5.2 組蛋白修飾誘導(dǎo)可變剪接
6.5.3 可變剪接與DNA甲基化
6.5.4 可變剪接與組蛋白變體
6.5.5 RNA與可變剪接
6.5.6 可變剪接的新模型
……
第7章 非編碼RNA研究進(jìn)展
第8章 假基因研究進(jìn)展
第9章 表觀遺傳學(xué)研究實(shí)驗(yàn)技術(shù)簡介
第10章 表觀遺傳學(xué)相關(guān)數(shù)據(jù)庫簡介
第11章 表觀遺傳學(xué)的功能