目錄 第1章從進化的觀點看疾病1 1.1生命起源進化概述1 1.1.1生命起源學說1 1.1.2生命進化歷程6 1.2人類起源進化歷程8 1.3生命進化與現(xiàn)代醫(yī)學10 1.3.1進化缺陷與疾病10 1.3.2基因突變與疾病11 1.3.3感染與防御反應12 1.3.4適應失調(diào)與疾病13 1.3.5腸道菌群進化與宿主健康14 1.3.6腸道菌群進化與疾病17 參考文獻19 第2章病理機制的進化解析24 2.1癌癥24 2.1.1原癌基因起源與細胞返祖現(xiàn)象24 2.1.2癌癥進展過程中的細胞群體進化27 2.1.3癌細胞進化的微環(huán)境效應30 2.2精神疾病36 2.2.1精神疾病與人腦進化關聯(lián)基因37 2.2.2精神疾病遺傳因素的兩面性40 2.2.3精神疾病與人類基因組加速進化區(qū)域42 2.3其他疾病45 2.3.1人類特異生理結(jié)構(gòu)與新生兒疾病45 2.3.2現(xiàn)代生活方式與慢性代謝性疾病52 參考文獻59 第3章傳染病病原體進化追溯68 3.1傳染病的起源與傳播68 3.1.1傳染病概述68 3.1.2傳染病的起源70 3.1.3傳染病的傳播72 3.2傳染病病原體74 3.2.1病原體源頭追溯75 3.2.2毒力進化追溯79 3.2.3傳染病病原體傳播84 3.2.4傳染病病原體在遷徙進化過程中的表現(xiàn)86 3.3細菌的進化追溯——以鼠疫桿菌為例88 3.3.1鼠疫桿菌概述88 3.3.2鼠疫桿菌的分型91 3.3.3鼠疫桿菌進化追溯技術(shù)91 3.3.4鼠疫桿菌的進化分析結(jié)果93 3.3.5研究鼠疫桿菌進化的意義94 3.4病毒的進化追溯——以HIV為例95 3.4.1HIV概述95 3.4.2HIV的起源96 3.4.3HIV的進化99 3.4.4HIV進化追溯的方法101 3.4.5研究HIV進化的意義102 參考文獻103 第4章耐藥性機制與進化抑制劑的發(fā)現(xiàn)106 4.1腫瘤耐藥性機制106 4.1.1腫瘤耐藥性機制概述106 4.1.2HSP90介導的腫瘤耐藥機制109 4.2腫瘤進化抑制劑111 4.2.1傳統(tǒng)的腫瘤耐藥性抑制劑111 4.2.2靶向HSP90的腫瘤進化抑制劑112 4.3微生物耐藥性機制118 4.3.1細菌耐藥性機制119 4.3.2真菌耐藥性機制124 4.3.3病毒耐藥性機制128 4.4傳染病耐藥性進化抑制劑132 4.4.1HSP90、HSP70、HSP60的結(jié)構(gòu)與功能133 4.4.2傳染病進化抑制劑137 參考文獻145 第5章進化啟發(fā)的藥物靶標與生物標志物鑒別156 5.1靶標鑒別對藥物發(fā)現(xiàn)的意義156 5.2Ohnolog基因啟發(fā)的靶標鑒別159 5.2.1Ohnolog基因與疾病159 5.2.2Ohnolog基因與靶標鑒別160 5.3基因起源階段啟發(fā)的靶標鑒別163 5.3.1基因起源階段與靶標鑒別163 5.3.2基因起源階段與抗病毒藥物靶標鑒別166 5.4進化啟發(fā)的高成藥潛力靶標鑒別177 5.4.1高成藥潛力靶標概述177 5.4.2基于進化增強知識圖譜的高成藥潛力靶標鑒別179 5.5進化啟發(fā)的生物標志物鑒別181 5.5.1生物標志物在精準醫(yī)療中的作用181 5.5.2Ohnolog基因與生物標志物鑒別183 5.5.3基因起源階段與生物標志物鑒別184 5.5.4進化啟發(fā)的生物標志物篩選188 參考文獻190 第6章天然藥物研究的進化啟示200 6.1天然藥物概述200 6.2天然藥物與新藥發(fā)現(xiàn)204 6.2.1天然藥物成藥潛力分析204 6.2.2天然藥物作為化學藥物的重要來源207 6.2.3天然藥物對組合藥物發(fā)現(xiàn)的啟發(fā)211 6.3天然藥物作用機制的進化解析215 6.3.1作用受體層面的解析215 6.3.2化合物結(jié)構(gòu)層面的解析217 6.4進化啟發(fā)的天然藥物發(fā)現(xiàn)219 參考文獻224