生物信息學是一門新興的交叉學科,它融合了生物學、計算機科學與數(shù)學等知識,被譽為21世紀生物科學發(fā)展的主導學科。《高等院校生物類專業(yè)系列教材:生物信息學》首先簡要介紹了國內外生物信息學的發(fā)展現(xiàn)狀和生物信息分析研究方法的最新動向,介紹了生物信息學的基礎知識和成熟的技術方法(序列比對、基因特征分析、引物設計、蛋白質結構預測等),闡述了生物信息數(shù)據庫及分子生物信息相關的分析技術,包括生物信息數(shù)據庫的結構分析和模擬構建技術,介紹了計算機輔助藥物設計技術和化學計量學方法,輔以實例說明,并在每章后面羅列了相關分析方法、軟件、工具及知識的重要免費網站作為知識拓展,以供參考。
《高等院校生物類專業(yè)系列教材:生物信息學》可作為非生物信息學專業(yè)的本科學生的生物信息學課程教材,也可作為生物學、農學、藥物設計等領域工作者的參考用書。
《高等院校生物類專業(yè)系列教材:生物信息學》的目的是使非生物信息學專業(yè),如生物學、農學、計算機科學、數(shù)學與統(tǒng)計科學等專業(yè)的學生能夠了解生物信息學的基本內涵、發(fā)展趨勢以及常用的分析工具和分析方法。 全書共分12章,內容包括:生物信息學概述,生物信息學的生物學基礎,數(shù)據庫的基本知識與生物信息數(shù)據庫的模擬構建,生物信息數(shù)據庫與網絡基礎,序列比對,分子進化與系統(tǒng)發(fā)育分析,基因預測與引物設計,蛋白質結構與預測,蛋白質組信息學,RNA結構與預測,生物芯片,生物信息學在計算機輔助藥物設計中的應用。
第1章 生物信息學概述
1.1 生物信息學的發(fā)展史
1.2 生物信息學主要研究內容
1.3 展望
第2章 生物信息學的生物學基礎
2.1 生物的分類
2.2 模式生物
2.3 生物大分子及其結構
2.4 分子生物學的中心法則
2.5 基因組及基因組結構
第3章 數(shù)據庫的基本知識與生物信息數(shù)據庫的模擬構建
3.1 數(shù)據庫系統(tǒng)概述
3.2 數(shù)據管理技術的發(fā)展
3.3 信息描述與數(shù)據模型
3.4 概念數(shù)據模型
3.5 常見的邏輯數(shù)據模型
3.6 數(shù)據庫系統(tǒng)結構
3.7 數(shù)據庫管理系統(tǒng)
3.8 生物信息數(shù)據庫的模擬構建
第4章 生物信息數(shù)據庫與網絡基礎
4.1 生物信息數(shù)據庫概述
4.2 核酸數(shù)據庫
4.3 蛋白質數(shù)據庫
4.4 生物大分子結構數(shù)據庫
4.5 其他數(shù)據庫
4.6 數(shù)據庫搜索
4.7 數(shù)據庫集成
第5章 序列比對
5.1 序列的相似性
5.2 序列比對的模型和依據
5.3 兩兩比對
5.4 多重比對
5.5 DNA片段組裝
第6章 分子進化與系統(tǒng)發(fā)育分析
6.1 引言
6.2 分子進化
6.3 分子系統(tǒng)發(fā)育分析
第7章 基因預測與引物設計
7.1 基因特征
7.2 基因預測
7.3 引物設計
第8章 蛋白質結構與預測
8.1 蛋白質的結構及其實驗測定方法
8.2 蛋白質分類
8.3 蛋白質結構預測算法
8.4 蛋白質結構預測軟件
第9章 蛋白質組信息學
9.1 蛋白質組學
9.2 蛋白質組信息學
9.3 蛋白質組分析的內容與基本方法
9.4 蛋白質組信息學相關資源
9.5 蛋白質組學的應用與前景
第10章 RNA結構與預測
10.1 RNA的種類及結構
10.2 RNA的功能
10.3 RNA的結構預測
10.4 RNA二級結構預測應用--非編碼RNA的預測
第11章 生物芯片
11.1 生物芯片概述
11.2 基因芯片
11.3 基因芯片數(shù)據分析
11.4 蛋白質芯片
11.5 細胞芯片
11.6 組織芯片
第12章 生物信息學在計算機輔助藥物設計中的應用
12.1 生物信息學用于新的藥物靶標的發(fā)現(xiàn)和確認
12.2 生物信息學在藥物篩選中的應用
12.3 定量構效關系