隨著分子遺傳學和分子生物技術(shù)的發(fā)展,大量DNA水平上的分子標記及其檢測技術(shù)隨之出現(xiàn),并廣泛應(yīng)用于圖譜構(gòu)建、遺傳多樣性研究、品種鑒別、基因定位、基因克隆、分子標記輔助選擇和育種,取得了驕人的成績。基于作者近年來在分子標記領(lǐng)域取得的研究成果,并參考了國內(nèi)外相關(guān)領(lǐng)域的最新進展,編著了《水稻DNA指紋及應(yīng)用》!端綝NA指紋及應(yīng)用》詳細了介紹了DNA指紋的發(fā)展、種類和應(yīng)用。
第一章 DNA指紋圖譜概述
第一節(jié) DNA指紋圖譜的產(chǎn)生
一 可變重復(fù)序列的發(fā)現(xiàn)
二 DNA指紋圖譜的建立
第二節(jié) DNA指紋圖譜的發(fā)展
一 形態(tài)學標記(Mollahological matkers)
二 細胞學標記(Cytological markers)
三 生化標記(Biochemical markers)
四 DNA分子標記(Molecular markers)
第三節(jié) DNA指紋圖譜的特點
一 DNA指紋圖譜的基本特點
二 DNA分子標記的優(yōu)點
三 DNA分子標記的要求
第四節(jié) DNA指紋圖譜應(yīng)用
一 法醫(yī)學
二 動植物科學
三 流行病學
第二章 DNA指紋技術(shù)類型
第一節(jié) DNA指紋技術(shù)分類
一 根據(jù)檢測手段及相關(guān)技術(shù)分類
二 根據(jù)DNA指紋技術(shù)的發(fā)展分類
第二節(jié) 常見的DNA指紋技術(shù)
一 限制性片段長度多態(tài)性(Restriction fragment length polymorophism,RFLP)
二 單鏈構(gòu)象多態(tài)性(Single strand conformation polymorphism,SSCP)
三 變性梯度凝膠電泳(Denaturing gradient gel electrophoresis,DGGE)
四 原位雜交(in situ Hybridation,ISH)
五 序列標記位點(Sequence—tagged site,STS)
六 隨機擴增多態(tài)性DNA(Random amplified polymorphic DNA,RAPD)
七 序列特征化擴增區(qū)域(Sequence charactered amplified region,SCAR)技術(shù)
八 隨即引物PCR(Random primer PCR.RP-PCR)
九 DNA擴增指紋技術(shù)(DNA amplification finger-printing,DAF)
十 擴增的限制性內(nèi)切酶片段長度多態(tài)性(Amplified fragment length polymorphism,AFLP)
十一 簡單序列重復(fù)(Simple sequence repeat,SSR)
十二 簡單重復(fù)序列間區(qū)(Inter—simple sequence repeat,ISSR)
十三 逆轉(zhuǎn)錄PCR(Reverse transcription PCR.RT.PCR)
十四 差異顯示逆轉(zhuǎn)錄PCR(Differential display reverse transcription PCR,DDRT-PCR)
十五 表達序列標簽(Expressed sequence tags,EST)
十六 單核苷酸多態(tài)性(Single nucleotide polymorphism,SNP)
第三節(jié) 新型的DNA指紋技術(shù)
一 抗病基因同源序列(Resistance gene analogs,RGAs)
二 隨機微衛(wèi)星擴增多態(tài)DNA(Random microsatellite amplify polymorphic DNA,RMAPD)
三 相關(guān)序列擴增多態(tài)性(Sequence related amplifiedpolymorphism,SRAP)
四 靶位區(qū)域擴增多態(tài)性(Target region amplified polymorphism,TRAP)
第三章 DNA指紋圖譜數(shù)據(jù)分析
第一節(jié) 遺傳標記的分類
一 質(zhì)量性狀
二 數(shù)量性狀
第二節(jié) 遺傳標記研究方法
一 遺傳相似分析
二 遺傳標記間相關(guān)性
第四章 SSR與水稻遺傳多樣性研究
第一節(jié) 植物遺傳多樣性研究
一 植物遺傳多樣性研究意義
二 植物遺傳多樣性研究手段
三 遺傳多樣性分析方法
第二節(jié) SSR標記對稻屬AA染色體組個種間多樣性與親緣關(guān)系分析
一 稻屬的分類及種質(zhì)資源
二 SSR與水稻遺傳多樣性研究進展
三 稻屬AA染色體組8個種間多樣性與親緣關(guān)系分析
第三節(jié) SSR標記對粳稻遺傳多樣性的研究
一 研究背景及意義
二 SSR與粳稻遺傳多樣性
第四節(jié) 秈稻品種的遺傳多樣性分析
一 秈稻遺傳多樣性研究背景
二 SSR與秈稻遺傳多樣性
第五節(jié) SSR標記對稽稻分類地位的研究
一 研究背景及意義
二 稽稻分類地位的研究
第五章 DNA分子標記與常規(guī)育種技術(shù)相結(jié)合快速聚合抗性基因
第一節(jié) 水稻主要病蟲害抗性遺傳與多抗育種發(fā)展現(xiàn)狀
一 稻瘟病抗性遺傳與育種
二 白葉枯病抗性遺傳與育種
三 稻飛虱抗性遺傳與育種
四 多抗育種發(fā)展現(xiàn)狀
第二節(jié) 利用CAPS標記和花藥培養(yǎng)相結(jié)合的方法快速聚合水稻抗性基因
一 xa-5基因的分子標記與精細定位和克隆
二 xa-5分子標記與花藥培養(yǎng)相結(jié)合培育優(yōu)質(zhì)多抗水稻
三 討論
參考文獻