第1章　兩派權(quán)威學(xué)者進化史觀的差異 1
1.1　辛普森：達(dá)爾文以后的進化研究 3
1.2　木村資生：從拉馬克到中立學(xué)說 6
第2章　19世紀(jì)達(dá)爾文后的兩位偉大進化論學(xué)者 19
2.1　對魏斯曼和海克爾具有影響的19世紀(jì)思潮 19
2.1.1　達(dá)爾文的進化理論的確立 19
2.1.2　自然神論和因果聯(lián)系決定論 19
2.2　成就魏斯曼和�？藸柕目茖W(xué)背景 23
2.2.1　細(xì)胞學(xué)取得的成果 23
2.2.2　胚胎學(xué)取得的成果 25
2.2.3　古生物學(xué)狀況：特創(chuàng)論當(dāng)?shù)?27
2.2.4　遺傳學(xué)狀況：混合遺傳觀念主導(dǎo) 27
2.3　魏斯曼 28
2.3.1　魏斯曼關(guān)于遺傳問題的見解 30
2.3.2　魏斯曼《生殖質(zhì)說一種遺傳理論》的序言 32
2.3.3　魏斯曼的生殖質(zhì)假說 36
2.3.4　魏斯曼的進化思想 37
2.4　�？藸� 38
2.4.1　�？藸柶淙� 38
2.4.2　�？藸柪L制出第一個生物進化系統(tǒng)樹 39
2.4.3　海克爾系統(tǒng)樹中的缺失的環(huán)節(jié) 41
2.4.4　�？藸栒J(rèn)為全部生物最早的共同祖先是Monera 42
2.4.5　原蟲說 45
2.4.6　�？藸柕脑�蟲說在馬克思主義哲學(xué)上的價值 46
2.4.7　海克爾的重演說 47
2.4.8　一元論哲學(xué)的倡導(dǎo)者 50
第3章　達(dá)爾文主義的低谷時期 53
3.1　新拉馬克主義 53
3.2　定向進化理論 54
3.3　德弗里斯的突變論 55
3.4　生物統(tǒng)計學(xué)派與孟德爾學(xué)派的論爭 57
第4章　進化的綜合理論 59
4.1　進化的綜合理論的主要特點 59
4.2　進化的綜合理論有兩個發(fā)源地 60
4.3　數(shù)理群體遺傳學(xué)（或稱群體遺傳學(xué)） 61
4.4　進化遺傳學(xué) 66
4.4.1　突變類型的概念 67
4.4.2　基因突變 67
4.4.3　基因重組 68
4.4.4　染色體畸變 68
4.4.5　堿基置換 70
4.4.6　插入與缺失 72
4.4.7　基因組重復(fù) 74
4.4.8　基因作用的多效性 75
4.4.9　突變與生存率關(guān)系的相對性 76
4.5　遺傳多樣性 76
4.5.1　遺傳多樣性的概念 76
4.5.2　愛爾蘭大饑荒 76
4.5.3　群體的命運視基因庫的情況而定 77
4.5.4　基因水平轉(zhuǎn)移是增加遺傳多樣性的有效方式 77
4.5.5　物種的歷史長短與遺傳多樣性的大小有關(guān) 77
4.5.6　基因組分析技術(shù)的進步會發(fā)現(xiàn)許多異常多樣性 79
4.5.7　保持作物和家畜的遺傳多樣性 79
第5章　生物多樣性與分類學(xué)發(fā)展 80
5.1　人類對生物多樣性的認(rèn)識源遠(yuǎn)流長 80
5.2　古希臘、古羅馬及我國的古代學(xué)者對物種多樣性的認(rèn)識 81
5.3　世界上第一個植物園、動物園、博物館的誕生，有力地推動了人們對物種多樣性的認(rèn)82
5.4　分類學(xué)是人類最早認(rèn)識物種多樣性的學(xué)問，林耐的偉大貢獻 83
5.4.1　植物學(xué)和動物學(xué)由于林耐而到達(dá)了一種近似的完成 83
5.4.2　《自然體系》是林耐最重要的著作 84
5.4.3　林耐創(chuàng)立了二名法及人為分類體系 85
5.4.4　林耐派遣其弟子奧斯貝克來中國采集 86
5.4.5　林耐的先驅(qū)們 87
5.4.6　林耐的世界觀與歷史唯物主義評價 88
5.4.7　林耐的榮譽與晚年 89
5.5　人為分類向自然分類的過渡 89
5.6　分類學(xué)向系統(tǒng)分類學(xué)的轉(zhuǎn)變 91
5.7　邁爾與斯特賓斯 91
第6章　物種與物種形成 93
6.1　定義物種概念的困難 93
6.2　生物學(xué)種概念 94
6.3　綜合理論權(quán)威學(xué)者們論物種概念 95
6.4　對邁爾種定義的批評與質(zhì)疑 96
6.5　生殖隔離的起源 97
6.6　生殖隔離機制的種類 98
6.6.1　生殖前隔離 99
6.6.2　交配后隔離 100
6.6.3　特殊環(huán)境條件下，異種間的生殖隔離可以消除 101
6.7　物種數(shù)目與物種分化的關(guān)系 101
6.8　物種分化的樣式 102
6.8.1　物種分化的總樣式 102
6.8.2　物種分化的古典樣式：異域性種分化 102
6.8.3　同域性種分化 103
6.8.4　鄰域性種分化 105
6.8.5　原域性種分化 105
第7章　古生物學(xué)發(fā)展與辛普森的重大貢獻 106
7.1　對古生物的認(rèn)識過程 106
7.1.1　前古希臘時期及古希臘時期 106
7.1.2　中世紀(jì)時期 107
7.1.3　文藝復(fù)興時期 107
7.1.4　17世紀(jì)到 18世紀(jì)初108
7.1.5　布豐對化石的見解 108
7.2　研究化石的學(xué)問與進化論同時登場，兩者一開始就激烈沖突 109
7.2.1　法國國立自然史博物館的三位學(xué)者 109
7.2.2　古生物學(xué)和地質(zhì)學(xué)迎來發(fā)展的隆盛期 111
7.3　在達(dá)爾文進化論啟迪下一些古生物學(xué)家朝著正確方向前進 113
7.4　特創(chuàng)論古生物學(xué)家猛烈攻擊達(dá)爾文學(xué)說 114
7.5　描述古生物學(xué)為后來進化論的發(fā)展積累了豐富的資料 117
7.6　新拉馬克主義和定向進化理論興起 117
7.7　辛普森使古生物學(xué)成為進化綜合理論的中堅力量 120
7.7.1　辛普森其人 120
7.7.2　辛普森通過馬科動物研究，批判新拉馬克主義和定向進化理論 121
第8章　自然選擇 127
8.1　適應(yīng)度 127
8.2　正選擇與負(fù)選擇 128
8.3　自然選擇作用的三種方式 128
8.3.1　穩(wěn)定化選擇 128
8.3.2　方向性選擇 129
8.3.3　分裂化選擇 130
第9章　進化的規(guī)模 132
9.1　小進化 133
9.2　中進化 136
9.2.1　夏威夷群島上生息著非常多的果蠅種類 136
9.2.2　夏威夷群島形成的地質(zhì)學(xué)背景 137
9.2.3　唾腺染色體研究闡明了翅膀有圖案果蠅的系統(tǒng)關(guān)系 138
9.2.4　翅膀有圖案的果蠅的種分化機制 140
9.3　大進化 141
9.3.1　突變與跳躍理論 141
9.3.2　適應(yīng)帶轉(zhuǎn)移與量子進化理論 141
9.3.3　同源異形基因的突變與大進化 144
9.3.4　生物大量滅絕 152
第10章　分子進化的中立理論 154
10.1　傳統(tǒng)的進化綜合理論受到嚴(yán)厲挑戰(zhàn) 154
10.2　分子進化序說（木村資生） 155
第11章　中立理論的發(fā)展 168
11.1　支持中立理論的證據(jù) 168
11.1.1　分子進化速度的一定性 168
11.1.2　置換速度依功能的重要程度而有所差異 168
11.1.3　較之非同義置換，同義置換的速度大 169
11.1.4　不具有功能的DNA區(qū)域進化速度快 169
11.2　中立理論及大致中立理論的發(fā)展 169
第12章　人類基因組計劃完成，進化學(xué)步入新時代 176
12.1　基因組概念的由來與演變 176
12.2　實施人類基因組計劃的技術(shù)前提 176
12.3　人類基因組計劃醞釀經(jīng)過 177
12.4　人類基因組計劃啟動及重要成果 178
12.5　人基因組的特征 179
12.5.1　具有蛋白質(zhì)信息的基因數(shù)意外地少 179
12.5.2　在人的基因組中看到有細(xì)菌基因存在 179
12.5.3　在人的基因組中還有轉(zhuǎn)座子基因 180
12.5.4　在人的基因組中有大量重復(fù)DNA序列 180
12.5.5　單核苷酸多態(tài)性 180
12.5.6　堿基的缺失或插入 180
12.5.7　人的突變率 180
12.5.8　變異速度 181
第13章　進一步認(rèn)識人類自身 182
13.1　人類基因組研究的哲學(xué)意義 182
13.2　基因組和表型組的研究相結(jié)合才能更好認(rèn)識進化 182
13.3　達(dá)爾文關(guān)于人類起源的見解 183
13.4　黑猩猩與大猩猩孰與人類最近？ 184
第14章　人類進化的化石研究 187
14.1　人類的特征 187
14.2　最古的人類 188
14.3　南方古猿階段 190
14.3.1　南方古猿屬（Australopithecus）含 6個種 191
14.3.2　傍人屬（Paranthropus）是粗壯型的南方古猿 195
14.4　人屬的特點、起源與擴張 197
14.4.1　人屬的一般特點 197
14.4.2　人屬的起源 199
第15章　智人是如何進化來的 210
15.1　智人的概貌 210
15.2　尼安德特人 210
15.2.1　尼安德特人的發(fā)現(xiàn) 210
15.2.2　尼安德特人被認(rèn)定為智人 211
15.2.3　尼安德特人的起源、分布與滅絕 211
15.3　現(xiàn)代人（Homo sapiens sapiens） 213
15.3.1　現(xiàn)代人的特征 214
15.3.2　現(xiàn)代人的起源 217
參考文獻231
附錄 進化學(xué)史年表235
人名索引241
結(jié)束語246